Лекция для врачей "Нормальная микрофлора тела человека. Дисбактериоз" (отрывок из книги "Медицинская микробиология, вирусология и иммунология. Атлас-руководство" - Быков А. С.)
Нормальная микрофлора тела человека
Человек заселен (колонизирован) примерно 1000 видами микробов, составляющими его нормальную микрофлору (микробиоту), в виде сообщества (микробиоценоза) массой около 1,5 кг, содержащего 1014 особей (наше тело содержит только 1013 клеток!), причем преобладают облигатные анаэробы. Микробы находятся в состоянии равновесия (эубиоза) друг с другом и организмом человека, составляя вместе суперорганизм, в котором гены человека взаимодействуют с метагеномом — коллективным геномом населяющих его бактерий и архей. Большинство из них являются синантропными микробами, не причиняющими вреда человеку, т.е. комменсалами. Каждый человек имеет уникальное микробное «сообщество», которое варьирует в зависимости от диеты, окружающей среды, генетики, возраста (полноценная микрофлора формируется у ребенка к трем годам), массы тела, сопутствующих заболеваний, медикаментозной терапии, состояния иммунной и нейроэндокринной систем. Эти факторы влияют на физиологию кишечника и кожи, устойчивость к инфекциям и другим болезням, метаболизм, настроение и даже на массу тела человека. Например, микрофлора худощавого человека весьма отличается от микрофлоры человека с ожирением. Пожилые люди имеют менее разнообразную микрофлору, в соответствии с проблемами здоровья, обусловленными особенностями возраста.
Организм человека проявляет пероральную, или оральную (региональную), толерантность к собственной нормальной микрофлоре (рис. 3.33). Эта толерантность обусловлена блокадой активации сигнальных рецепторов (TLR и др.) к компонентам микрофлоры человека, активностью антимикробных пептидов и регуляторных Т-лимфоцитов (TReg). Срыв оральной толерантности влечет развитие хронического гастрита, болезни Крона, неспецифического язвенного колита, язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, некротизирующего энтероколита у детей. Микрофлора колонизирует поверхность тела и полости, сообщающиеся с окружающей средой. В норме микробы отсутствуют в легких, матке, мочевом пузыре и внутренних органах.
Различают постоянную и транзиторную микрофлору. Постоянная (резидентная, индигенная, или автохтонная) микрофлора представлена микробами, постоянно присутствующими в организме. Транзиторная (непостоянная, или аллохтонная) микрофлора неспособна к длительному существованию в организме.
____________________
* Синантропные организмы — организмы, образ жизни которых связан с человеком и его жильем.
Постоянную микрофлору можно разделить на облигатную и факультативную. Облигатная микрофлора (бифидобактерии, лактобактерии, бактероиды, кишечная палочка и др.) является основой микробиоценоза, а факультативная микрофлора (стафилококки, стрептококки, клебсиеллы, некоторые грибы и др.) включает меньшую часть микробиоценоза.
Микрофлора слизистых оболочек заключена в высокогидратированный экзополисахаридно-муциновый матрикс, образуя на поверхности барьерных тканей биологическую пленку, устойчивую к различным воздействиям. Плотность популяции микробов и их взаимоотношения определяются понятием quorum sensing (QS), или «ощущением кворума» (чувство локтя), описывающим механизмы их саморегуляции в биопленках.
Кожа. На коже и в ее более глубоких слоях (волосяных мешочках, протоках сальных и потовых желез) анаэробов в 2—10 раз больше, чем аэробов. Различные участки кожи (сальные, влажные в складках кожи и сухие, плоские) отличаются составом бактерий типов Actinobacteria (семейства Propionibacteriaceae, Corynebacterineae, Micrococcineae и др.), Firmicutes (семейства Staphylococcaceae, Streptococcaceae и др.), Bacteroidetes, Proteobacteria и даже Cyanobacteria. Это прежде всего грамположительные (пропионибактерии, коринеформные бактерии, эпидермальные стафилококки и другие коагулазоотрицательные стафилококки*, микрококки, стрептококки, пептострептококки, Dermabacter hominis), а также грамотрицательные бактерии (рода Acinetobacter и др.) и дрожжеподобные грибы рода Malassezia. Реже встречается транзиторная микрофлора: Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes и др. (рис. 3.32). При ослаблении организма количество бактерий возрастает, появляются вирусы простого герпеса, папилломавирусы** и грибы. Грибы рода Candida spp. редко колонизируют кожу человека, но могут привести к кандидозу, особенно в условиях иммунодефицита, диабета или после использования антибиотиков.
Клещи рода Demodex (например, Demodex folliculorum и Demodex brevis) также рассматриваются как часть нормальной флоры кожи. Они питаются кожным салом и более распространены после полового созревания, предпочитая колонизировать сальные области лица. Исторически данные клещи были связаны.
___________________
* 5. hominis, S. hoemolyticus, S. warneri, S. capitis (на лбу, лице), 5. saprophyticus, S. caprae, S. saccharolyticus, S. pasteuri, S. lugdunensis, S. simulans, S. xylosis. Внешний слуховой канал колонизирует 5. auricularis.
** Папилломавирусы человека инфицируют и размножаются в сквамозном эпителии кожи, образуя доброкачественные бородавки (папилломы), и в слизистых оболочках, вызывая генитальные, оральные и конъюнктивальные папилломы; индуцируют пролиферацию эпителия, обладают онкогенным потенциалом (см. рис. 4.32).
Конъюнктива содержит небольшое количество коринеформных бактерий и стафилококков из-за действия лизоцима и других бактерицидных факторов слезной жидкости.
Верхние дыхательные пути содержат бактероиды, коринеформные бактерии, гемофильные палочки, лактобактерии, стафилококки, стрептококки, нейссерии, пептококки, пептострептококки и др. Трахея, бронхи и альвеолы обычно стерильны.
Ротовая полость. Ассоцианты нормальной микрофлоры и продукты их жизнедеятельности образуют зубной налет (бляшки). В 1 мл слюны обитает до 108 бактерий, чему способствуют остатки пищи во рту, благоприятная температура (37 °C) и щелочная реакция среды. Анаэробов больше, чем аэробов, в 10 и более раз. Преобладают бактероиды, превотеллы, порфиромонады, бифидобактерии, эубактерии, фузобактерии, лактобактерии, актиномицеты, гемофильные палочки, лептотрихии, нейссерии, стрептококки, стафилококки, пептококки, пептострептококки, вейлонеллы, спирохеты и др. Обнаруживаются также грибы рода Candida и простейшие (Entamoeba gingivalis, Trichomonas ten ах).
Бактерии имеют определенное топографическое распространение, в том числе и в зубной бляшке. В развитии зубной бляшки сначала участвуют кокки (Streptococcus gordonii, Streptococcus mitis, Streptococcus oralis и Streptococcus sanguinis), связывающиеся co слюнными рецепторами (муцином, пролин-богатым протеином, а-амилазой, слюнным агглютинином) и фрагментами бактерий на пелликуле, покрывающей зубную поверхность. Позднее связываются и коагрегируют другие бактерии (Porphyromonas gingivalis, Prevotella denticola, Tannerella forsythia, Трепонема denticola, Capnocytophaga spp^, Actinomyces spp., Aggregatibacter actinomycetemcomitans и др.).
Состав микрофлоры рта регулируется механическим действием слюны и языка; микробы смываются слюной со слизистой оболочки и зубов (человек проглатывает в день около литра слюны). Антимикробные пептиды и антитела подавляют адгезию посторонних микробов к эпителиоцитам. С другой стороны, бактерии образуют полисахариды: S. sanguis и S. mutans преобразуют сахарозу во внеклеточный полисахарид (глюканы, декстраны), участвующий в адгезии к поверхности зубов. Колонизации постоянной частью микрофлоры способствует фибронектин, покрывающий эпителиоциты и обладающий сродством к грамположительным бактериям.
Пищевод практически не содержит микроорганизмов.
Рис. 3.32. Резидентная и факультативная микрофлора кожи
Желудок содержит лактобациллы, дрожжи, единичные кокки и грамотрицательные бактерии. Концентрация бактерий меньше 103 клеток на 1 мл, так как желудочный сок имеет низкое значение pH, неблагоприятное для многих микробов. Желудок в норме — это своеобразная стерилизационная камера (соляная кислота, пепсиноген — предшественник пепсина и др.), подавляющая патогенные микробы. При гастритах, язвенной болезни желудка обнаруживаются изогнутые бактерии рода Helicobacter, которые являются этиологическими факторами многих патологических процессов (гастрит, язвы, опухоли).
Кишечник содержит просветную и пристеночную (мукозную) кишечную микрофлору. Рост посторонней микрофлоры задерживается в результате антагонистических свойств нормальной микрофлоры, блокирующего действия slgA и антимикробных пептидов (рис. 3.33). У младенцев угнетающим действием также обладает лактоферрин, поступающий с грудным молоком матери. Тонкая кишка вблизи желудка имеет более кислую среду, чем вблизи толстой кишки. По этой причине количество бактерий, которые находятся в тонкой кишке, намного меньше, чем в толстой. При этом слой защитной слизи в ней более тонкий (однослойный), чем в толстой кишке, в которой он двухслойный (внутренний и наружный слои). Внутренний слой слизи формирует защищенную от бактерий зону в апикальной поверхности эпителиоцита, тогда как внешний слой слизи содержит большие количества бактерий. Слизь является смазкой для кишечной моторики. Слизь состоит из муцинов (основной муцин — Мис2), коллагенов, эластина, фибронектина, ламинина и slgA, а также протеогликанов. Гликопротеины муцина, выделяемые бокаловидными клетками, создают защитную гель-подобную буферную зону, простираемую вплоть до 150 мкм от поверхности эпителиальной клетки*.
В тонкой кишке находится 104-107 микробов на 1 мл содержимого. Здесь обнаруживаются бифидобактерии, лактобактерии, клостридии, эубактерии, энтерококки,анаэробные кокки, порфиромонады, превотеллы.
Толстая кишка содержит больше бактерий (1О10- 1012 на грамм фекалий), чем тонкая кишка. Около 95% всех видов микробов составляют анаэробные бактерии. Основными представителями микрофлоры толстой кишки являются бактерии типов Bacteroidetes, Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria и Verrucomicrobia (рис. 3.33): продукцию цитокинов (IL-12 и др.), которые способствуют дифференцировке ТН0 в ТН1 и подавляют продукцию IgE, участвующего в аллергии. Кроме того, стимулируются ILC, продуцирующие цитокины (IL-22 и др.) для защиты эпителиоцитов.
________________
* Эпителиальные клетки образуют ворсинки и кишечные крипты (см. рис. 7.3). Ворсинки тонкой кишки длиннее и крипты мельче, чем их аналоги в толстой кишке. Кишечный эпителий состоит из монослоя реплицирующихся клеток, связанных друг с другом через плотные соединения (tight junctions): энтероцитов (поглощают питательные вещества и секретируют антимикробные пептиды и противовоспалительные цитокины), бокаловидных (секретируют муцин) и энтероэндокринных клеток (вырабатывают гормоны, такие как серотонин, субстанция Р и секретин), расположенных в основании крипт наряду с клетками Панета, которые выделяют а-дефензины, фосфолипазу А2, лизоцим и другие антимикробные пептиды. Над пейеровыми бляшками (см. рис. 7.4) расположены М-клетки, которые предоставляют микробиота-производные антигены дендритным клеткам и макрофагам.
Микрофлора расщепляет в толстой кишке ранее не переваренную пищу до короткоцепочечных жирных кислот, водорода, метана и углекислого газа. Бактериальные короткоцепочечные жирные кислоты, или летучие жирные кислоты (масляная, уксусная, пропионовая кислоты и соответственно их производные — бутираты*, ацетат, пропионат), образуемые при брожении в результате ферментации некоторых пищевых белков, углеводов, волокон растительного происхождения и олигосахаридов женского молока, усиливают местный иммунитет и синтез нейромедиаторов. У новорожденных короткоцепочечные жирные кислоты в толстой кишке из-за отсутствия микрофлоры практически не определяются; их количество резко нарастает к 20-30-му дню жизни, достигая «взрослых» значений к 2 годам жизни.
Нормальная микрофлора участвует в модуляции поведения человека, взаимодействуя с энтероэндокринными клетками и нейронами кишечника. Нервная система кишечника производит около половины серотонина и дофамина тела человека. Нейротрансмиттеры влияют на настроение. Их низкие уровни причастны к таким нарушениям, как хронические боли, бессонница, депрессия, синдром раздраженного кишечника; низкий уровень дофамина связан с болезнью Паркинсона и шизофренией.
_______________
* Бутираты — соли и сложные эфиры масляной кислоты. Масляная кислота — одна из самых важных низкомолекулярных кислот, которые синтезируются в кишечнике. Основными продуцентами бутиратов в толстой кишке являются анаэробы: эубактерии (Eubacterium rectale, Е. ramulus, Е. hallii) наряду с Roseburia faecis, Roseburia cecicola, Faecalibacterium prausnitzii, Coprococcus spp, Anaerostipes hadrus и Christensenella minuta. Бутираты поддерживают кишечный гомеостаз, предотвращают развитие заболеваний ЖКТ, подавляют рост сальмонелл и шигелл. Бутираты являются важным источником энергии для колоноцитов, улучшают барьерные функции. Они активируют рецепторы GPR 109а, а также GPR41 и GPR43 (позже переименованы в FFAR3 и FFAR2), которые широко распространены в клетках человека, включая жировые клетки, эпителий тонкой и толстой кишок. Это активирует продукцию противовоспалительных молекул и цитокинов. В результате снижается воспаление, сопровождающее неспецифический язвенный колит и болезнь Крона. Поэтому разрабатываются лекарственные формы масляной кислоты для перорального приема. Количество бактерий продуцентов бутиратов уменьшается к старости. Потребление продуктов питания, богатых инулином и фруктоолигосахаридами (фруктанами), повышает продукцию бутирата бактериями кишечника. Нормализует состояние кишечника употребление более ферментированных пищевых продуктов, которые содержат богатый набор полезных бактерий и их метаболитов: йогурта, кефира и других кисломолочных продуктов, а также квашенных и маринованных овощей и фруктов.
Микрофлора участвует в колонизационной резистентности, которая является совокупностью защитных факторов организма и конкурентных, антагонистических и других свойств нормальной микрофлоры (в основном анаэробов) кишечника, придающих стабильность микрофлоре и предотвращающих колонизацию организма посторонними микробами. Для предотвращения инфекционных осложнений (в случае обширных травм, ожогов, иммунодепрессивной терапии, трансплантации органов и тканей и др.) целесообразно нормализовать колонизационную резистентность. Для чего проводят селективную деконтаминацию — избирательное удаление из пищеварительного тракта аэробных бактерий и грибов. Ее проводят путем приема внутрь малообсорбируемых химиопрепаратов, подавляющих аэробную часть микрофлоры и не влияющих на анаэробы, например комплексное назначение ванкомицина, гентамицина и нистатина.
Нормальная микрофлора участвует в водно-солевом обмене, регуляции газового состава и перистальтики кишечника, обмене белков, углеводов, жирных кислот, холестерина, нуклеиновых кислот, а также в продукции биологически активных соединений: аргинина, глютамина, токсинов, фолиевой кислоты, витаминов К, В12, В3 (ниацина) и др. Она участвует в переваривании и детоксикации экзогенных и эндогенных субстратов и метаболитов, что сравнимо с функцией печени. Кроме этого, она расщепляет полисахариды, для которых у человека нет ферментов; недавно описанные виды родов Bacteroides, Roseburia, Ruminococcus, а также Bifidobacterium adolescentis расщепляют целлюлозу и другие полисахариды, поддерживая высокие плотности бактерий в толстой кишке. Аккермансии (Akkermansia muciniphila) и христенсенеллы (Christensenella minuta) нормализуют метаболизм, препятствуют ожирению и развитию сахарного диабета.
Нормальная микрофлора участвует в рециркуляции стероидных гормонов и желчных солей в результате экскреции метаболитов из печени в кишечник и последующего возврата в нее. Она выполняет морфокинетическую роль в развитии различных органов и систем организма, участвует в физиологическом воспалении слизистой оболочки и смене эпителия, а также тепловом обеспечении организма.
Нормальная микрофлора выполняет антимутагенную функцию, разрушая канцерогенные вещества в кишечнике. В то же время некоторые бактерии могут продуцировать сильные мутагены. Ферменты бактерий кишечника преобразуют искусственный подсластитель цикломат в активный канцероген (циклогексамин) для мочевого пузыря.
Экзополисахариды (гликокаликс) микробов, входящие в состав биологической пленки, защищают их от разнообразных физико-химических воздействий. Слизистая оболочка кишечника также находится под защитой биологической пленки.
При снижении сопротивляемости организма нормальная микрофлора вызывает гнойно-воспалительные процессы (аутоинфекция, или эндогенная инфекция). Оказываясь при транслокации в непривычных местах обитания, они могут вызывать различные нарушения. Такие микробы называют условно-патогенными, или оппортунистами, а инфекции — оппортунистическими.
В результате действия микробных декарбоксилаз иЛПС высвобождается дополнительное количество гистамина, что может вызывать псевдоаллергические состояния.
Нормальная микрофлора служит хранилищем и источником хромосомных и плазмидных генов, властности генов лекарственной устойчивости к антибиотикам.
Отдельных представителей нормальной микрофлоры (например, кишечные палочки и сходные с ними цитробактеры, энтеробактеры, клебсиеллы) используют в качестве санитарно-показательных микроорганизмов, свидетельствующих о загрязнении окружающей среды (воды, почвы, воздуха, продуктов питания и др.) выделениями человека и, следовательно, о ее эпидемиологической опасности.
Дисбактериоз
Многие люди страдают от частых простуд, вялости, капризности, депрессии, тревоги, бессонницы, гиперактивности, аллергии, избыточного веса и от воспалительных процессов. Эти явления могут быть связаны не с поражением конкретных систем (дыхательной, нервной, скелетной или др.), а с нарушенной микробиотой — дисбактериозом и дисбиозом. Данные состояния развиваются в результате утраты нормальных функций микрофлоры и определяются как клинико-лабораторный синдром. Они происходят под влиянием внешних факторов, стрессовых воздействий, бесконтрольного применения антимикробных препаратов, лучевой терапии и химиотерапии, нерационального питания, оперативных вмешательств и т.д. Изменение состава микрофлоры ЖКТ, особенно ребенка, посредством медикаментов может привести к непредвиденным негативным последствиям для здоровья. При дисбактериозе происходят количественные и качественные изменения бактерий, входящих в состав нормальной микрофлоры. При дисбиозе изменения происходят и среди других групп микроорганизмов (вирусов, грибов и др.). Дисбиозы классифицируют по этиологии (грибковый, стафилококковый, протейный и др.) и по локализации (дисбиоз рта, кишки, влагалища и т.д.).
Различают дисбиоз тонкой кишки (синдром избыточного роста бактерий — СИБР, bacterial overgrowth syndrome) и дисбиоз толстой кишки. Изменения нормальной микрофлоры сопровождаются различными нарушениями: развитием инфекций, диареи, запора, ожирения, аутизма (преобладают бактерии рода Sutterella), синдрома мальабсорбции, гастрита, колита, язвенной болезни, злокачественных новообразований, аллергии, мочекаменной болезни, гипо- и гиперхолестеринемии, гипо- и гипертензии, кариеса, артрита, поражений печени, неврологических расстройств и др. Оказалось, что микробиота имеет двустороннюю связь с ЦНС, влияющую на эмоции, восприятие боли, ощущения и поведения. Ведется поиск пробиотиков, так называемых психобиотиков, для лечения таких состояний, как депрессия, тревога, и других психиатрических состояний.
Для восстановления нормальной микрофлоры проводят селективную деконтаминацию и назначают per os пребиотики, пробиотики, синбиотики, метабиотики и энтеросорбенты; в отдельных случаях (болезнь Крона, язвенный колит и псевдомембранозный колит) рекомендуется так называемая трансплантация фекальной микробиоты от здоровых доноров (см. Clostridium difficile, рис. 3.100).
• Пребиотики — вещества немикробного происхождения [волокна полисахаридной природы (инулин, гуммиарабик) и олигосахариды (олигофруктоза, лактулоза), ПАМБА (парааминометилбензойная кислота)], стимулирующие рост нормальной микрофлоры человека. Пребиотическими свойствами обладают растворимые волокна в бобовых, овсе, ячмене и другие цельных зерновых, а также чеснок, лук, спаржа, морковь, брокколи, бананы, цитрусовые и ягоды.
• Пробиотики (эубиотики) — препараты, содержащие живые бактерии,— представители нормальной микрофлоры кишечника, оказывающие нормализирующее действие на организм человека и его микрофлору, — бифидобактерии (бифидумбактерин), кишечные палочки (коли- бактерин), лактобактерии (лактобактерии) и др. (табл. 3.4). Другая группа пробиотиков — само- элиминирующиеся антагонистические микроорганизмы, в норме не обитающие в организме человека (Bacillus subtilis, В. licheniformis, Saccharomyces boulardii).
• Синбиотики — комбинированные препараты, состоящие из пробиотиков и пребиотиков: нормофлорины (лактобактерии, бифидобактерии и лактитол, комплекс витаминов, органических кислот, мурамилдипептид, микроэлементы и др.), бифидо-бак (лактобактерии, бифидобактерии и комплекс фруктоолигосахаридов из топинамбура) и др.
• Метабиотики — препараты, состоящие из метаболитов нормальной микрофлоры и их аналогов. Так, в 2009 г. был разработан препарат Zacol (Закофальк), содержащий масляную кислоту (в форме бутирата кальция) и пребиотик инулин.
• Энтеросорбенты — препараты, удаляющие из кишечника токсичные метаболиты и условно-патогенные бактерии (активированный уголь, энтеросгель и др.).
Диагностика нарушений микробиоценоза проводится с помощью бактериологического метода, ПЦР-диагностики, хроматомасс-спектрометрии и исследования метаболитов. Перспективен метод газожидкостной хроматографии, основанный на определении короткоцепочечных жирных кислот— метаболитов (в основном анаэробов).
Таблица 3.4. Пробиотики, зарегистрированные в Российской Федерации
Книга "Медицинская микробиология, вирусология и иммунология. Атлас-руководство"
Автор: Быков А. С.
В работе над данным изданием участвовали коллективы кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии (заведующий — академик РАН, профессор В.В. Зверев) и кафедры клинической иммунологии и аллергологии (заведующий — академик РАН, профессор А.В. Караулов) ФГАОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет). Материал изложен в соответствии с официально утвержденными федеральными государственными стандартами преподавания микробиологии (бактериологии, вирусологии, микологии, протозоологии) и иммунологии для студентов высшего профессионального образования, обучающихся по специальности 060101.65 «Лечебное дело», 060103.65 «Педиатрия », 060104.65 «Медико-профилактическое дело».
Согласно современным знаниям по бактериологии (Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd ed., 2001- 2013) и вирусологии (данные девятого доклада Международного комитета по таксономии вирусов, 2011) материалы издания были существенно пересмотрены, обновлен перечень микробов и диагностических исследований (соответствующий Приказу Минздравсоцразвития России № 1664н от 27 декабря 2011 г. «Об утверждении номенклатуры медицинских услуг»). Оригинальные схемы и рисунки выполнены с учетом современного состояния микробиологии и иммунологии.
Атлас может использоваться в сфере медицинского образования в вузах, колледжах и училищах (для студентов медицинского профиля приведен перечень экзаменационных вопросов со ссылкой на соответствующие темы); как справочник для врачей, специалистов лабораторий (перечень микробов и диагностических исследований соответствует Приказу М3 РФ от 21 февраля 2000 г. № 64 «Об утверждении номенклатуры клинических лабораторных исследований»).
Содержание книги "Медицинская микробиология, вирусология и иммунология. Атлас-руководство" - Быков А. С.
Часть 1. Медицинская микробиология (бактериология, вирусология, микология и протозоология)
Глава 1. Мир микробов
Классификация и номенклатура микробов
Глава 2. Микробиологическая (лабораторная) диагностика
Микроскопический метод диагностики
Приготовление препарата для световой микроскопии
Молекулярно-биологический метод диагностики
Глава 3. Бактериология
Общая бактериология
Классификация и формы бактерий
Формы бактерий
Структура бактериальной клетки
Физиология бактерий
Взаимодействие бактериофагов с бактериями
Питание и дыхание бактерий; анаэробиоз
Культивирование бактерий
Культуральный (бактериологический) метод диагностики
Генетика и особенности вирулентности бактерий
Секреторные системы бактериальной клетки
Токсины бактериальной клетки
Химиотерапевтические антимикробные средства
Экология микроорганизмов (микроэкология)
Распространение микробов в окружающей среде
Нормальная микрофлора тела человека
Значение микрофлоры организма человека
Дисбактериоз
Санитарная микробиология
Частная бактериология
Бактерии, имеющие медицинское значение
Грамположительные кокки
Стафилококки (род Staphylococcus)
Стрептококки (род Streptococcus)
Пневмококки (Streptococcus pneumoniae)
Энтерококки (род Enterococcus)
Пептококки (род Peptococcus)
Пептострептококки (род Peptostreptococcus)
Руминококки (род Ruminococcus)
Микрококки (род Micrococcus)
Другие грамположительные кокки (анаэрококки, копрококки, финегольды, пентофилы, парвимонады, гемеллы, дермакокки, Rothia mucilaginosa)
Грамотрицательные кокки
Гонококки (Neisseria gonorrhoeae)
Менингококки (Neisseria meningitidis)
Вейлонеллы (род Veillonella)
Мегасферы (род Megasphaera)
Akkermansia muciniphila
Грамотрицательные факультативно-анаэробные палочки
Энтеробактерии (семейство Enterobacteriaceae)
Эшерихии (род Escherichia)
Клебсиеллы (род Klebsiella)
Возбудитель донованоза (Klebsiella granulomatis)
Протеи (род Proteus)
Цитробактеры (род Citrobacter)
Энтеробактеры (род Enterobacter)
Морганеллы (род Morganella)
Серрации (род Serratia)
Эдвардсиеллы (род Edwardsiella), эрвинии (род Erwinia), гафнии (род Hafnia), провиденции (род Providencia), клюйверы (род Kluyvera)
Сальмонеллы (род Salmonella)
Возбудитель брюшного тифа (Salmonella Typhi)
Возбудители паратифов (Salmonella Paratyphi A и Salmonella Paratyphi B)
Возбудители сальмонеллеза (Salmonella Enteritidis и др.)
Шигеллы (род Shigella)
Иерсинии (род Yersinia)
Возбудитель чумы (Yersinia pestis)
Возбудитель кишечного иерсиниоза (Yersinia enterocolitica)
Возбудитель псевдотуберкулеза (Yersinia pseudotuberculosis)
Вибрионы (род Vibrio)
Возбудитель холеры (Vibrio cholerae)
Гемофилы (род Haemophilus)
Палочка инфлюэнцы (Haemophilus influenzae)
Возбудитель мягкого шанкра (Haemophilus ducreyi), пастереллы, актинобациллы, Aggregatibacter actinomycetemcomitans, аэромонады, кингеллы, эйкенеллы
Грамотрицательные аэробные палочки
Бордетеллы (род Bordetella)
Возбудитель коклюша (Bordetella pertussis)
Буркхольдерии (род Burkholderia)
Бартонеллы (род Bartonella)
Бруцеллы (род Brucella)
Возбудитель туляремии (Francisella tularensis)
Легионеллы (род Legionella)
Возбудитель Ку-лихорадки (Coxiella burnetii)
Псевдомонады (род Pseudomonas)
Синегнойная палочка (Pseudomonas aeruginosa)
Моракселлы (род Moraxella)
Ацинетобактеры (род Acinetobacter)
Стенотрофомонады (род Stenotrophomonas)
Суттереллы (род Sutterella)
Грамотрицательные анаэробные палочки
Бактероиды (род Bacteroides)
Превотеллы (род Prevotella)
Ксиланибактеры (род Xylanibacter)
Рикенеллы (род Rikenella)
Алистипесы (род Alistipes)
Таннереллы (род Tannerella)
Порфиромонады (род Porphyromonas)
Фузобактерии (род Fusobacterium)
Лептотрихии (род Leptotrichia)
Снеатии (род Sneathia)
Капноцитофаги (род Capnocytophaga)
Фекалибактерии (род Faecalibacterium)
Розебурии (род Roseburia)
Христенсенеллы (род Christensenella)
Селеномонады (род Selenomonas)
Десульфовибрионы (род Desulfovibrio)
Билофилы (род Bilophila)
Грамположительные спорообразующие палочки
Сибиреязвенная бацилла (Bacillus anthracis)
Bacillus cereus
Клостридии (род Clostridium)
Возбудитель столбняка (Clostridium tetani)
Возбудители газовой гангрены (Clostridium perfringens, C. novyi, C. ramosum, C. histolyticum, C. septicum)
Возбудитель ботулизма (Clostridium botulinum)
Clostridium difficile
Грамположительные неправильные палочки и ветвящиеся формы
Erysipelothrix rhusiopathiae
Эубактерии (род Eubacterium)
Лактобациллы (род Lactobacillus)
Листерии (род Listeria)
Коринебактерии (род Corynebacterium)
Возбудитель дифтерии (Corynebacterium diphtheriae)
Микобактерии (род Mycobacterium)
Возбудители туберкулеза (M. tuberculosis, M. bovis, M. africanum)
Возбудители микобактериоза
Микобактерии лепры (M. leprae)
Мобилункусы (род Mobiluncus)
Актиномицеты (род Actinomyces)
Нокардии (род Nocardia)
Стрептомицеты (род Streptomyces)
Пропионибактерии (род Propionibacterium)
Бифидобактерии (род Bifidobacterium)
Гарднереллы (род Gardnerella)
Атопобиумы (род Atopobium)
Спирохеты и другие изогнутые и спиральные бактерии
Трепонемы (род Treponema)
Возбудитель сифилиса (Treponema pallidum подвид pallidum)
Боррелии (род Borrelia)
Возбудитель эпидемического возвратного тифа (Borrelia recurrentis)
Возбудители клещевого возвратного тифа
Возбудитель болезни Лайма (Borrelia burgdorferi)
Лептоспиры (род Leptospira)
Кампилобактерии (род Campylobacter)
Хеликобактерии (род Helicobacter)
Helicobacter pylori
Волинеллы (род Wolinella)
Спириллы (род Spirillum)
Другие бактерии (риккетсии, хламидии, микоплазмы и др.)
Риккетсии (род Rickettsia)
Риккетсии, имеющие медицинское значение
Ориенции (род Orientia)
Семейство Anaplasmataceae (анаплазмы, неориккетсии и эрлихии)
Хламидии (семейство Chlamydiaceae)
Chlamydia trachomatis
Chlamydia pneumoniae
Chlamydia psittaci
Микоплазмы (род Mycoplasma)
Дополнение
Клостридиальные и неклостридиальные облигатные анаэробы
Неферментирующие бактерии
Глава 4. Вирусология
Общая вирусология
Структура вирусов
Классификация вирусов
Репродукция вирусов
Культивирование и индикация вирусов
Бактериофаги (фаги)
Частная вирусология
Основные вирусы человека и животных (классификация и вызываемые болезни)
ДНК-содержащие вирусы
Поксвирусы (семейство Poxviridae)
Герпесвирусы (семейство Herpesviridae)
Аденовирусы (семейство Adenoviridae)
Папилломавирусы (семейство Papillomaviridae)
Полиомавирусы (семейство Polyomaviridae)
Парвовирусы (семейство Parvoviridae)
Анелловирусы (семейство Anelloviridae)
РНК-содержащие вирусы
Реовирусы (семейство Reoviridae)
Пикорнавирусы (семейство Picornaviridae)
Калицивирусы (семейство Caliciviridae)
Вирус гепатита Е (семейство Hepeviridae)
Астровирусы (семейство Astroviridae)
Коронавирусы (семейство Coronaviridae)
Флавивирусы (семейство Flaviviridae)
Тогавирусы (семейство Togaviridae)
Буньявирусы (семейство Bunyaviridae)
Аренавирусы (семейство Arenaviridae)
Филовирусы (семейство Filoviridae)
Рабдовирусы (семейство Rhabdoviridae)
Ортомиксовирусы (семейство Orthomyxoviridae)
Парамиксовирусы (семейство Paramyxoviridae)
Борнавирусы (семейство Bornaviridae)
Вирус гепатита D (род Deltavirus)
Ретровирусы (семейство Retroviridae)
Гепаднавирусы (семейство Hepadnaviridae, вирус гепатита В)
Дополнение
Медленные вирусные инфекции и прионные болезни
Возбудители острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ)
Арбовирусы и робовирусы
Возбудители вирусных гепатитов
Глава 5. Протозоология
Общая протозоология
Строение и классификация простейших
Частная протозоология
Простейшие, имеющие медицинское значение
Лямблии, или гиардии (род Lamblia, или Giardia)
Мочеполовая трихомонада (Trichomonas vaginalis)
Другие трихомонады
Трипаносомы (род Trypanosoma)
Лейшмании (род Leishmania)
Возбудитель амебиаза (Entamoeba histolytica)
Свободноживущие амебы
Токсоплазма (Toxoplasma gondii)
Саркоцисты (род Sarcocystis)
Изоспоры (род Isospora)
Криптоспоридии (род Cryptosporidium)
Циклоспоры (Cyclospora cayetanensis)
Плазмодии малярии (род Plasmodium)
Бабезии (род Babesia)
Балантидии (Balantidium coli)
Бластоцисты (Blastocystis hominis)
Глава 6. Микология
Общая микология
Строение и классификация грибов
Частная микология
Клиническая классификация заболеваний (микозов), вызываемых грибами
Возбудители поверхностных микозов (кератомикозов)
Малассезии (род Malassezia)
Phaeoannellomyces werneckii
Piedraia hortae
Trichosporon beigelii
Возбудители эпидермофитий (эпидермомикозов, дерматомикозов)
Epidermophyton floccosum
Microsporum audouinii
Microsporum ferrugineum
Trichophyton tonsurans
Trichophyton violaceum
Trichophyton interdigitale (Trichophyton mentagrophytes var. interdigitale)
Trichophyton rubrum
Trichophyton schoenleinii
Microsporum canis
Microsporum gallinae
Trichophyton verrucosum
Trichophyton mentagrophytes var. mentagrophytes
Microsporum cookei
Microsporum gypseum
Microsporum nanum
Возбудители подкожных, или субкутанных, микозов
Возбудитель споротрихоза (Sporothrix schenckii)
Возбудители хромобластомикоза
Возбудители феогифомикоза
Возбудители гиалогифомикоза
Возбудители мицетомы
Энтомофторамикозы
Возбудители системных (глубоких) эндемических микозов
Histoplasma capsulatum
Blastomyces dermatitidis
Paracoccidioides brasiliensis
Coccidioides immitis
Возбудители оппортунистических микозов (поверхностных или глубоких)
Кандиды (род Candida)
Мукор (род Mucor)
Ризопус (род Rhizopus)
Микроспоридии (класс Microsporidia)
Аспергиллы (род Aspergillus)
Пенициллы (род Penicillium)
Фузарии (род Fusarium)
Пневмоцисты — Pneumocystis (carinii) jirovecii
Cryptococcus neoformans
Возбудители микотоксикозов
Часть 2. Иммунология и аллергология
Глава 7. Иммунология и аллергология
Иммунитет и компоненты иммунной системы
Органы и ткани иммунной системы
Антигены
Врожденный иммунитет
Фагоцитоз
Нейтрофилы
Эозинофилы, базофилы и тучные клетки
Тромбоциты
Моноциты/макрофаги
Дендритные клетки
NK- и NKT-лимфоциты
Лимфоциты врожденного иммунитета
Образраспознающие рецепторы
Формы клеточной смерти
Комплемент
Лектины
Белки острой фазы
Антимикробные пептиды
Белки теплового шока
Опсонины
Цитокины
Адаптивный иммунитет
Антитела, строение и функции иммуноглобулинов
Свойства антител
Презентация антигена, Т- и В-лимфоциты
Субпопуляции Т-лимфоцитов
Субпопуляции CD4+ Т-лимфоцитов (Т-хелперы и Т-регуляторные лимфоциты)
Цитотоксические Т-лимфоциты
Субпопуляции В-лимфоцитов
Иммунологическая память и иммунологическая толерантность
Иммунный ответ: гуморальный и клеточный
Противобактериальный, противовирусный, противогрибковый, противопротозойный, противогельминтный, противоопухолевый и трансплантационный иммунитет
Аллергия. Типы гиперчувствительности
Иммунный статус
Иммуномодуляторы
Иммунодиагностические реакции «антиген–антитело»
Реакция агглютинации
Реакция непрямой (пассивной) гемагглютинации (РНГА, или РПГА)
Реакция коагглютинации
Реакция Кумбса
Реакция торможения гемагглютинации
Реакция преципитации
Реакция нейтрализации
Реакция связывания комплемента
Реакция радиального гемолиза
Реакция иммунного прилипания
Реакция иммунофлюоресценции
Иммуноферментный анализ
Радиоиммунный анализ
Радиоаллергосорбентный тест
Иммуноблоттинг
Иммунная электронная микроскопия
Проточная цитометрия
Экзаменационные вопросы
Предметный указатель
Указатель микроорганизмов
